Protein–RNA interactions for Protein: Q66L44

Cbarp, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbarpQ66L44 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CbarpQ66L44 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CbarpQ66L44 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CbarpQ66L44 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms