Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Clcn1Q64347 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Clcn1Q64347 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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Clcn1Q64347 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
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Clcn1Q64347 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
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Clcn1Q64347 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
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Clcn1Q64347 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Clcn1Q64347 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Clcn1Q64347 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
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