Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pou4f3Q63955 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pou4f3Q63955 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms