Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Smarcd1Q61466 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Smarcd1Q61466 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Smarcd1Q61466 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms