Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Abcd2Q61285 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Abcd2Q61285 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms