Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gbp4Q61107 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gbp4Q61107 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gbp4Q61107 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms