Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tns3Q5SSZ5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tns3Q5SSZ5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tns3Q5SSZ5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tns3Q5SSZ5 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.3 ms