Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Psme4Q5SSW2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Psme4Q5SSW2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Psme4Q5SSW2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms