Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbm27Q5SFM8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbm27Q5SFM8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbm27Q5SFM8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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