Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fbxo39Q5NBU5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fbxo39Q5NBU5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms