Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rtl5Q5DTT4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rtl5Q5DTT4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rtl5Q5DTT4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms