Protein–RNA interactions for Protein: Q504N7

Pyrin and HIN domain-containing protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q504N7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q504N7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q504N7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q504N7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Q504N7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q504N7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q504N7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q504N7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q504N7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q504N7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q504N7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q504N7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q504N7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q504N7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.2 ms