Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3V9

Carmil2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil2Q3V3V9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Carmil2Q3V3V9 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Carmil2Q3V3V9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Carmil2Q3V3V9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.9 ms