Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pacs2Q3V3Q7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Pacs2Q3V3Q7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pacs2Q3V3Q7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 307.7 ms