Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4930567H17RikQ3V0K5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4930567H17RikQ3V0K5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4930567H17RikQ3V0K5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms