Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnpc3Q3UZ01 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnpc3Q3UZ01 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rnpc3Q3UZ01 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms