Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Skap1Q3UUV5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Skap1Q3UUV5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms