Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTE2

Gm428, Predicted gene 428, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm428Q3UTE2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm428Q3UTE2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm428Q3UTE2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm428Q3UTE2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms