Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BB287469Q3UT53 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
BB287469Q3UT53 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms