Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Acsf3Q3URE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Acsf3Q3URE1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Acsf3Q3URE1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.9 ms