Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Wdr41Q3UDP0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Wdr41Q3UDP0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms