Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rundc1Q0VDN7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rundc1Q0VDN7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rundc1Q0VDN7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms