Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
StumQ0VBF8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
StumQ0VBF8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms