Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Siah2Q06986 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah2Q06986 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms