Protein–RNA interactions for Protein: Q05AH6

SPINDOC, SPIN1-docking protein, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINDOCQ05AH6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SPINDOCQ05AH6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPINDOCQ05AH6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPINDOCQ05AH6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPINDOCQ05AH6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms