Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Caprin2Q05A80 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Caprin2Q05A80 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Caprin2Q05A80 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms