Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r236Q05A06 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r236Q05A06 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms