Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Apoa1Q00623 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Apoa1Q00623 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Apoa1Q00623 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms