Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tarbp2P97473 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tarbp2P97473 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tarbp2P97473 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms