Protein–RNA interactions for Protein: P80314

Cct2, T-complex protein 1 subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct2P80314 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cct2P80314 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct2P80314 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct2P80314 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cct2P80314 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cct2P80314 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cct2P80314 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cct2P80314 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cct2P80314 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms