Protein–RNA interactions for Protein: P62962

Pfn1, Profilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn1P62962 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pfn1P62962 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pfn1P62962 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms