Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rhbdl3P58873 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rhbdl3P58873 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rhbdl3P58873 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.2 ms