Protein–RNA interactions for Protein: P55065

Pltp, Phospholipid transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PltpP55065 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PltpP55065 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PltpP55065 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PltpP55065 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PltpP55065 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PltpP55065 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PltpP55065 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PltpP55065 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PltpP55065 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PltpP55065 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PltpP55065 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PltpP55065 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PltpP55065 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PltpP55065 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PltpP55065 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PltpP55065 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PltpP55065 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PltpP55065 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PltpP55065 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PltpP55065 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PltpP55065 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PltpP55065 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PltpP55065 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PltpP55065 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PltpP55065 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PltpP55065 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PltpP55065 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PltpP55065 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PltpP55065 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PltpP55065 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PltpP55065 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PltpP55065 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PltpP55065 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PltpP55065 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PltpP55065 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PltpP55065 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms