Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NrlP54846 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NrlP54846 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NrlP54846 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NrlP54846 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NrlP54846 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NrlP54846 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NrlP54846 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NrlP54846 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NrlP54846 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NrlP54846 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NrlP54846 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NrlP54846 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NrlP54846 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NrlP54846 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NrlP54846 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NrlP54846 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NrlP54846 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NrlP54846 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NrlP54846 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NrlP54846 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NrlP54846 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NrlP54846 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NrlP54846 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NrlP54846 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NrlP54846 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NrlP54846 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NrlP54846 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NrlP54846 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NrlP54846 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NrlP54846 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NrlP54846 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NrlP54846 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NrlP54846 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NrlP54846 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NrlP54846 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NrlP54846 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NrlP54846 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NrlP54846 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NrlP54846 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NrlP54846 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms