Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.57■■■□□ 2.81
Map3k1P53349 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Map3k1P53349 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Map3k1P53349 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Map3k1P53349 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms