Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgd1P52734 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgd1P52734 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgd1P52734 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms