Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccl9P51670 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccl9P51670 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms