Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tmod1P49813 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tmod1P49813 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmod1P49813 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms