Protein–RNA interactions for Protein: P48757

Gast, Gastrin, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GastP48757 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GastP48757 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GastP48757 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GastP48757 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GastP48757 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GastP48757 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GastP48757 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GastP48757 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GastP48757 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GastP48757 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GastP48757 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GastP48757 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GastP48757 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GastP48757 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GastP48757 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GastP48757 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GastP48757 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GastP48757 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GastP48757 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms