Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox2P48432 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox2P48432 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sox2P48432 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox2P48432 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox2P48432 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sox2P48432 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms