Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cdkn1bP46414 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cdkn1bP46414 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms