Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NodalP43021 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NodalP43021 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NodalP43021 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NodalP43021 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NodalP43021 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
NodalP43021 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NodalP43021 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NodalP43021 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NodalP43021 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NodalP43021 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NodalP43021 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NodalP43021 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NodalP43021 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NodalP43021 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NodalP43021 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NodalP43021 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms