Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ly6dP35459 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ly6dP35459 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ly6dP35459 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms