Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxrgP28705 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxrgP28705 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxrgP28705 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxrgP28705 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxrgP28705 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxrgP28705 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RxrgP28705 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RxrgP28705 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxrgP28705 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxrgP28705 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxrgP28705 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxrgP28705 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RxrgP28705 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxrgP28705 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RxrgP28705 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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