Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctnna1P26231 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctnna1P26231 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctnna1P26231 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms