Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tpm3P21107 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tpm3P21107 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tpm3P21107 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.7 ms