Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lama1P19137 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lama1P19137 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lama1P19137 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lama1P19137 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lama1P19137 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Lama1P19137 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Lama1P19137 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lama1P19137 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lama1P19137 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lama1P19137 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms