Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18528 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18528 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18528 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18528 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P18528 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P18528 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P18528 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18528 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18528 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18528 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18528 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P18528 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P18528 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P18528 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18528 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18528 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18528 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P18528 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18528 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18528 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18528 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18528 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18528 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18528 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18528 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P18528 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P18528 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P18528 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
P18528 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18528 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18528 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18528 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
P18528 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms