Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pou4f1P17208 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pou4f1P17208 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pou4f1P17208 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms