Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Fgf4P11403 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fgf4P11403 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fgf4P11403 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms